Plusieurs groupes de travail fonctionnent ou ont fonctionné, sur des problématiques concernant la biodiversité, sur l'escalade et les rochers et sur l'éducation à l'environnement. Ils réunissent les acteurs (associations, administrations, élus, scientifiques) intéressés par le thème des deux côtés de la frontière. Ainsi, le groupe " biodiversité " a consacré des réunions de connaissances réciproques sur la forêt, les milieux ouverts, les ruisseaux et zones humides, les espèces remarquables, les inventaires du patrimoine naturel et Natura 2000. Un groupe de travail spécifique sur le lynx s'est déjà réuni de nombreuses fois.

Après une phase d'information mutuelle, les groupes de travail s'orientent maintenant vers un travail de proposition d'actions communes comme c'est le cas avec le groupe " éducation ".